De eerste beschrijvingen van het gebied rond de haven Flaauwers, waaraan De Heerenkeet ligt, stammen uit 1576. De haven in zijn huidige vorm stamt ongeveer uit 1850 en diende voor het vervoer van landbouwproducten naar de fabrieken in Brabant.

De eerste herberg op Flaauwers –een ‘zoeteltente’ werd gesticht in 1763 nadat een dam werd aangelegd naar de zandplaat voor de kust.
Een ‘keet’ onder aan de dijk diende onder de naam “d’Eerenkeete” vanaf 1852 als vergaderplaats voor de dijkgraven: de “Heeren van Schouwen”. De herbergier was verplicht de “Heeren” van het een en ander te voorzien.
In 1914 kreeg de uitspanning zijn definitieve naam.
In 1943 werd de herberg door de bezetter gesloopt waarna deze weer in 1948 werd herbouwd.
Tijdens de watersnood was de Heerenkeet –hoog boven het water- een toevluchtsoord voor omwonenden.

Anno 2008 is De Heerenkeet nog steeds een oord waar iedereen die graag van het uitzicht of van de (zee)verse heerlijkheden geniet, zijn toevlucht neemt.